Templo y Ex Convento de San Francisco, fue el primer edificio religioso construido en Querétaro y sirvió de eje para el desarrollo urbano de la ciudad. Su construcción se inició en el siglo XVI, pero de aquellas edificaciones no quedó ningún rastro. Hasta mediados del siglo XIX integró, aparte del templo y el convento, un conjunto religioso que incluía 5 capillas, un cementerio, un  huerto y un gran atrio, que ocupaban en total un área cercana a las 3 hectáreas. Las capillas mencionadas fueron demolidas durante la Guerra de Reforma, algunas de ellas a cañonazos. El templo de San Francisco funcionó como catedral de Querétaro entre los años de 1865 y 1922. El convento es hoy Museo Regional, cuya existencia debemos al empreño y dedicación del maestro Don Germán Patiño. El museo se encuentra abierto de las 10 a 18 horas, excepto los lunes.